消毒器應水平安裝在室內，將支架固定基礎或工作臺上，接通進水口，出水口，殺菌裝置在室內的位置，除考慮上下水方便，符合工藝流程要求外，還要注意留有安裝位置能抽出紫外線燈管和空間，電控箱安裝在裝置附近，環境相對濕度不大于80℃，無腐蝕性氣體、無導電塵埃、無強烈震動和沖擊。

　　影響紫外線殺菌效果的因素是紫外線的強度、紫外線光譜的波長和照射時間。

　　在使用管道式紫外線消毒器時應注意的事項為：

　　安裝位置：紫外線安裝的位置離使用點越近越好，但也應留有從一端裝進或抽出石英管套和更換燈管的操作空間。

　　流量：在同一殺菌器內，當紫外線的輻射能量一定，水中細菌含量變化不大時通過殺菌器的水流量大小對殺菌效果有顯著的影響。

　　水的物理化學性質：水的色度、濁度、總鐵含量對紫外線都有不同程度的吸收，其結果使殺菌的效果降低。

　　燈管功率：燈管的點燃功率對殺菌效率影響很大。

　　燈管周圍的介質溫度：紫外線燈管輻射光譜能量與燈管管壁的溫度有關。

　　石英管套：適應管套的質量和壁厚與紫外線的透過率有關，石英管套的純度高，效率好。

　　水層厚度：水層厚度對管道式紫外線消毒器殺菌效果有很大的關系。